infercnv报错Error in base::rowMeans(x, na.rm = na.rm, dims = dims, ...) : ‘x‘ must be an array of a

跑infercnv的过程中报错Error in base::rowMeans(x, na.rm = na.rm, dims = dims, ...) :'x' must be an array of at least two dimensionsinfercnv::run函数跑到第三步骤就进行不下去了，网上搜索解决办法，发现github上有人给出建议参考Error in base::rowMean

小羊小羊，遇事不难

2523人浏览 · 2022-06-27 23:45:39

小羊小羊，遇事不难 · 2022-06-27 23:45:39 发布

跑infercnv的过程中报错

Error in base::rowMeans(x, na.rm = na.rm, dims = dims, ...) :
'x' must be an array of at least two dimensions

infercnv::run函数跑到第三步骤就进行不下去了，

网上搜索解决办法，发现github上有人给出建议

参考Error in base::rowMeans(x, na.rm = na.rm, dims = dims, ...) : 'x' must be an array of at least two dimensions · Issue #276 · broadinstitute/infercnv · GitHub

试了上面的方法，删除了只有0,1个细胞的C10,C11后跑成功了。

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